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1 、 高度重复序列
占人类基因组的10%；由很短的DNA序列组成，长度为2~ 200bp，一般为几个、十几个或几十个bp，重复拷贝数为106~ 108；在染色体的端粒、Y染色体长臂的异染色区，有些散在分布，有些串联重复，均不能转录。
作用：
构成基因间隔；维系染色体的结构；与减数分裂中同源染色体联会配对有关。
卫星DNA
当DNA片段进行氯化铯密度梯度离心时，可以看到一个主带或峰。此外，经常还可以看到一些较小的带或主峰的肩。这些小峰的DNA被称为卫星DNA。只有当卫星DNA与主峰DNA之间的碱基组成不同时，才能看到分开的峰；卫星DNA峰的数目和位置对于物种来说具有特征性。
卫星DNA片段的G-C碱基对含量高于或低于主峰DNA的G-C碱基对，通常存在于着丝粒、端粒、Y染色体长臂的结构性异染色质区,卫星DNA在氯化铯梯度中的位置决定于它们的碱基组成；
维持染色体的结构，形成基因间隔，与减数分裂中同源染色体联会有关。
小卫星DNA：6~25个核苷酸串联重复序列；
微卫星DNA：2~6个核苷酸串联重复序列，在人类基因组有多态性。
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